常用数据库按国家分类详细介绍（转贴）
一、美国
(1)Wiley InterScience(英文文献期刊) Wiley InterScience是John Wiely & Sons
公司创建的动态在线内容服务，1997年开始在网上开通。通过InterScience，Wiley公司以许可协议形式向用户提供在线访问全文内容的服务。Wiley
InterScience收录了360多种科学、工程技术、医疗领域及相关专业期刊、30多种大型专业参考书、13种实验室手册的全文和500多个题目的Wiley学术图书的全文。其中被SCI收录的核心期刊近200种。期刊具体学科划分为：Business,
Finance & Management (商业、金融和管理)、Chemistry (化学)、Computer Science
（计算机科学）、Earth Science （地球科学）、Education （教育学）、Engineering （工程学）、Law
（法律）、Life and Medical Sciences （生命科学与医学）、Mathematics and Statistics
（数学统计学）、Physics （物理）、Psychology （心理学） 。
(2)美国IEEE (英文文献期刊)
IEEE（Institute of Electrical & Electronics
Engineers）是电子信息领域最著名的跨国性学术团体，其会员分布在世界150多个国家和地区。据IEEE统计，IEEE会员总数2001年比2000年增加3.1%，达到377342人，其中学生会员为65669人，增长12.6%。
随着人们的信息越来越多地来自Internet，IEEE需要为会员提供更加完善和全面的电子信息产品和服务。IEEE应成为IEEE会员获得信息的首选之地。IEEE必须识别正确的信息，并提供对它们的访问方法。实现这个目标的重要一步是通过IEEE
Xplore与IEEE/IEE Electronic Library
(IEL)连接。IEL包括了1988年以来IEEE和IEE的所有期刊杂志和会议录，以及IEEE的标准，可以通过题目、关键词和摘要进行查阅。
===============================================
(3)美国EBSCO(英文文献期刊)
http://ejournals.ebsco.com
数据库简介：
EBSCO公司从1986年开始出版电子出版物，共收集了4000多种索引和文摘型期刊和2000多种全文电子期刊。该公司含有Business
Source Premier （商业资源电子文献库）、Academic Search Elite（学术期刊全文数据库）等多个数据库。
Business Source
Premier收录了三千多种索引、文摘型期刊和报纸，其中近三千种全文刊。数据库涉及国际商务、经济学、经济管理、金融、会计、劳动人事、银行等的主题范围，适合经济学、工商管理、金融银行、劳动人事管理等专业人员使用。数据库中有较著名"华尔街日报"（The
Walls Street Journal）、"哈佛商业评论"（Harvard Business
Review）、"每周商务"（Business Week）、"财富"（Fortune）、"经济学家智囊团国家报告" (EIU
Country Reports)、 American Banker、Forbes、The
Economist等报刊。该数据库从1990年开始提供全文，题录和文摘则可回溯检索到1984年，数据库每日更新。
学术期刊集成全文数据库（Academic Search
Premier，简称ASP）：包括有关生物科学、工商经济、资讯科技、通讯传播、工程、教育、艺术、文学、医药学等领域的七千多种期刊，其中近四千种全文刊。
640Emuch.NetFjnuZW11Y2geE5
EBSCO内含有两个免费数据库：
ERIC为(Educational Resource Information Center)
(教育资源信息中心)是美国教育部的教育资源信息中心数据库，收录980多种教育及和教育相关的期刊文
献的题录和文摘，包括250多种EBSCO收录的全文杂志教育文献数据库，数据为
1967至今。
Newspaper Source (报纸资源)
Newspaper Source收录159种美国地方报纸、18种国际性报纸、6个新闻专线、
9个报纸专栏，包括基督教科学箴言报、洛山矶时报等194种报纸的全文。 另 外还收录4种美国全国性报纸的索引和摘要。
Academic Search Elite 多学科学术期刊 全文
Academic Search Premier 多学科学术期刊 全文
Business Source Elite 商业、管理、财经 全文
Business Source Premier 商业、管理、财经 全文
EconLit 经济学 文摘
Communication & Mass Media Complete (CMMC) 传播和大众传媒 全文
AGRICOLA 农业 文摘
EBSCO Hospital Package 医学、生物医学
MEDLINE 医学 文摘
Biomedical Reference Coll.: Comp. Ed. 生物医学 全文
Health Business Elite 医疗管理 全文
Psychology & Behavioral Sci. Coll.: Comp. Ed. 心理学和行为科学 全文
CINAHL 医学 - 护理学 文摘
Nursing & Allied Health Coll.: Comp. Ed. 医学 - 护理学 全文
Cochrane Collection 医学 - 护理学 全文 (IPA) 药学 文摘
SPORTDiscus 医学 - 运动医学 文摘
PsycINFO 心理学 文摘
ERIC 教育学 文摘
Professional Development Collection 教育学 全文
Canadian MAS FULLTEXT Elite 中、小学期刊读物 全文
Scientific American Archive Online 综合性科技期刊 全文
EBSCO Language & Literature Collection 语言文学数据库集锦
American Humanities Index 人文科学 文摘
MLA International Bibliography 语言文学 文摘
Cloumbia Granger's Poetry Database 诗歌 全文
MagillOnLiterature Plus 文学 全文
Military Library FullTEXT 军事 全文
MasterFILE Premier 综合性期刊 全文
Newspaper Source 综合性报纸 全文
World Magazine Bank 综合性杂志 全文
===============================================
(4)美国(umi)ProQuest
博士论文全文 ,是UMI公司的一个分库（我分析之后得来的。）
UMI公司简介：
该公司的全称是UMI，The answser Company
(UMI有问必答公司），成立于1938年，是全球最大的信息存储和发行商之一，也是美国学术界著名的出版商，它向全球160多个国家提供信息服务，内容涉及商业管理、社会科学、人文科学、新闻、科学与技术、医药、金融与税务等。其出版物包括18，000多种外文缩微期刊、7000多种缩微报纸、150多万篇博士/硕士论文、20多万种绝版书及研究专集：从1980年起该公司开始电子出版物的制作与发行：如光盘数据库、磁带数据库、联机数据库等。
UMI提供以下三种数据库：
学术研究图书馆（Academic Research Library，简称ARL）
综合参考及人文社会科学期刊论文数据库，涉及社会科学、人文科学、商业与经济、教育、历史、传播学、法律、军事、文化、科学、医学、艺术、心理学、宗教与神学、社会学等学科，收录2，300多种期刊和报纸，其中全文刊占三分之二，有图像。可检索1971年来的文摘和1986年来的全文。
商业信息数据库（ABI/INFORM）
ABI即为Abstracts of Business
Information的缩写，世界著名商业及经济管理期刊论文数据库，收录有关财会、银行、商业、计算机、经济、能源、工程、环境、金融、国际贸易、保险、法律、管理、市场、税收、电信等主题的1，500多种商业期刊，涉及这些行业的市场、企业文化、企业案例分析、公司新闻和分析、国际贸易与投资、经济状况和预测等方面，其中全文刊超过50%，其余为文摘，有图像。
医学电子期刊全文数据库（ProQuest Medical Library）
该数据库收录有220种全文期刊，文献全文以PDF格式或文本加图像格式存储；收录范围包括所有保健专业的期刊，有护理学、儿科学、神经学、药理学、心脏病学、物理治疗及其它方面。
ProQuest博士论文全文检索系统, PQDD的全称是ProQuest Digital
Dissertations，是世界著名的学位论文数据库，收录有欧美1，000余所大学文、理、工、农、医等领域的博士、硕士学位论文，是学术研究中十分重要的信息资
源 ...
http://proquest.umi.com/pqdweb
===============================================
(5)美国Netlibrary(英文电子图书):
http://www.netlibrary.com
NetLibrary处在美国科罗拉多州波尔德尔市，于1999年成立，是世界上向图书馆提供电子图书的主要提供商。NetLibrary于2002年1月25日成为OCLC联机计算机图书馆中心的下属部门。目前，世界上7000多个图书馆通过netLibrary存取电子图书，其中包括哥伦比亚大学，斯坦福大学，加州大学伯克莱分校，以及世界上其他成千的大小图书馆。
OCLC
netLibrary目前提供400多家出版社出版的60,000多种电子图书，并且每月增加约2,000种。这些电子图书覆盖所有主题范畴，约80%的书籍是面向大学程度的读者。大多数NetLibrary的电子图书内容新颖，近90%的电子图书是1990年后出版的。
netLibrary是OCLC的一个部门，是当前世界上eBook的主要提供商，它提供来自300多个出版商的50,000多种高质量电子图书，这些电子图书的90%是1990年后出版的，每月均增加几千种。
＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝
二、荷兰
（1)Sciencedirect: 荷兰Elsevier
Science公司出版的期刊是世界上公认的高品位学术期刊，它拥有1263种电子全文期刊数据库，并已在清华大学图书馆设立镜像站点：ScienceDirect
OnSite（SDOS）。国内11所学术图书馆于2000年首批联合订购SDOS数据库中1998年以来的全文期刊。
国内镜像：
http://elsevier.lib.tsinghua.edu.cn/
http://www.sciencedirect.com/
http://www.sciencedirect.com/sci
http://www.sciencedirect.com/sci
http://www.sciencedirect.com/sci
===============================================
（2)荷兰OVID(英文文献期刊)，现为Wolters Kluwer集团之一
OVID科技公司是由总裁Mark Nelson于1984年创立于纽约，由一人开始营业，扩展
至目前已有将近200人。分公司分布于世界各地，如：雪梨、伦敦、巴黎……等地。
公司名称也从最早的Online Research System改名为CD Plus，CDP echnologies，而至目前的OVID
Technologies，以强调突显Ovid公司与客户及软体间的专业关系。
Ovid是一全球性的资讯公司，以创造容易撷取资讯、独立于平台之媒介为使命。无论我们的顾客使用Dos、Windows、Unix或全球资讯网和Java平台，皆可经由Ovid一般使用者介面轻易地撷取资讯。
公司的发展最初由医学起家，从Medline至目前已包涵人文、社会、科技等近百种资料库。
1984 发展第一代检索界面
1990 发表CDPNet，建立第一套以PC为基础，经由Novell环境检索的网路系统
1991 发表CDPNet Version 2.0，并荣获Information World Review评为年度最佳产品
1992 Beta version of Ovid 3.0成为Medline第一个Windows界面的产品
1993 发表Unix版系统，并荣获Information Today评为最佳使用界面及检索引擎
1994 1. 并购BRS公司，开启CDP Online业务
1995 1. 发表Windows和VT-100界面Z39.50相容的Ovid Client/Server
2. 发表Ovid Core Biomedical Collection及Ovid全文系统
3. 荣获Business Week评为全美排行第14大成长迅速的公司
1996 发表Z39.50相容的Ovid Web Gateway
1997 发表第一套Java检索介面－Ovid Java Client
1998 1. 发表400种STM(Science Technology Medicine)电子全文期刊
2. 九月份Wolters Kluwer采购Ovid公司股票，Ovid公司原为检索软体出版公司，现为Wolters
Kluwer集团之一员，因Wolters
Kluwer公司为全球知名900种期刊之出版商，故现今Ovid除了出版检索软体，也是Information Provider。
http://gateway.ovid.com
=============================================== （3)Kluwer:含电子图书和期刊.
荷兰Kluwer Academic
Publisher是具有国际性声誉的学术出版商，它出版的图书、期刊一向品质较高，备受专家和学者的信赖和赞誉。Kluwer
Online是Kluwer出版的600余种期刊的网络版，专门基于互联网提供Kluwer电子期刊的查询、阅览服务。
＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝
三、英国
（1)英国Ingenta(英文文献期刊)
Ingenta网站是Ingenta公司于1998年建成的学术信息平台。在几年的发展中，该公司先后兼并了多家信息公司，合并了这些公司的数据库。2001年，Ingenta公司兼并了Catchword公司，近期Ingenta准备将两家公司的信息平台整合为一体。在整合之前，用户可分别从Ingenta.com和Catchword.com查询对方提供的全部信息。整合后可提供全球190多个学术出版机构的全文联机期刊5,400多种，以及26,000多种其它类型出版物。目前，Ingenta公司在英国和美国多个城市设有分公司，拥有分布于世界各地的10,000多个团体用户和2,500多万个个人用户，已成为全球学术信息服务领域的一个重要的文献检索系统。
ingenta
http://www.ingenta.com/
===============================================
（2)英国Blackwell(英文文献期刊)
(www.blackwell-synergy.com)
Blackwell出版公司是世界上最大的期刊出版商之一(总部设在英国伦敦的牛津)，以出版国际性期刊为主，包含很多非英美地区出版的英文期刊。它所出版的学术期刊在科学技术、医学、社会科学以及人文科学等学科领域享有盛誉。
近年来，Blackwell出版的期刊不断发展。目前，Blackwell出版期刊总数已超过700种，其中理科类期刊占54%左右，其余为人文社会科学类。涉及学科包括：农业、动物学、医学、工程、数学统计、计算机技术、商业经济、生命科学、物理学、人文科学、艺术、社会及行为科学等。
180Emuch.NetV5ZW11Y2geE5
Blackwell出版期刊的学术质量很高，很多是各学科领域内的核心刊物，据最新统计，其中被SCI收录的核心期刊有239种，被SSCI收录的有118种。
Blackwell-Synergy journals
http://www.blackwell-synergy.com/
＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝＝
四、德国
springer
德国施普林格(Springer-Verlag)是世界上著名的科技出版集团, 通过Springer
LINK系统提供学术期刊及电子图书的在线服务。
Springer公司和 EBSCO/Metapress 公司现已开通Springer LINK电子期刊服务。目前Springer
LINK所提供的全文电子期刊共包含439种学术期刊(其中近400种为英文期刊)，按学科分为以下11个"在线图书馆"：生命科学、医学、数学、化学、计算机科学、经济、法律、工程学、环境科学、地球科学
、物理学与天文学，是科研人员的重要信息源。
目前大部分期刊可以阅读全文，但也有一些期刊尚不能阅读全文，一般规律是：显示pdf字样的，可以打开全文，显示remote
pdf字样的，则不能打开全文，目前代理公司正在解决此事。
Springer Link 涵盖的学科范围及种数：
Law (法律): 5种 Environmental (环境科学): 37 种
Medicine (医学): 179种 Geoscience (地球科学): 53种 Mathematics (数学): 73种
Life Science (生命科学): 105种
Economics (经济学): 30种 Chemical Sciences (化学): 36种
Engineering (工程): 58种 Computer Science (计算机科学):45种
Physics and Astronomy(物理与天文学):61种
附：（1)wiley 和spring可以通过代理注册,注意的是wiley需要激活，而且wiley90天以后必须进入代理续激活。
(2)sd只能通过代理获取相关文献,注册以后也不能脱离代理。
(3)springer搜索完以后，前面有眼镜的是可以直接下载观看的，而那些没有的则是要会费的。
SCOPUS数据库介绍
SCOPUS是Elsevier公司开发的文摘索引数据库，
使用说明
SCOPUS是Elsevier公司开发的文摘索引数据库，它收录了来自全球4000家
出版社的14000多种文献 (主要为期刊)，涵盖了2700万条文摘，学科覆盖数学、物
理学、化学、生物学、生命科学、农业、地球和环境科学、工程、心理学、社会科
学等领域。
SCOPUS数据库有以下几个主要特点：
1） 可以检索论文被其它文献引用的情况；
2） 可以检索到上至19世纪发表的文章；
3） 无缝链接至互联网上的全文文献和本馆的其他图书馆资源。
生物信息学相关数据库介绍（转贴）
数据库是生物信息学的主要内容，各种数据库几乎覆盖了生命科学的各个领域。核酸序列数据库有GenBank, EMBL, DDB等，蛋白质序列数据库有SWISS-PROT, PIR, OWL, NRL3D, TrEMBL等，蛋白质片段数据库有PROSITE, BLOCKS, PRINTS等，三维结构数据库有PDB, NDB, BioMagResBank, CCSD等，与蛋白质结构有关的数据库还有SCOP, CATH, FSSP, 3D-ALI, DSSP等，与基因组有关的数据库还有ESTdb, OMIM, GDB, GSDB等，文献数据库有Medline, Uncover等。另外一些公司还开发了商业数据库,如MDL等。生物信息学数据库覆盖面广，分布分散且格式不统一, 因此一些生物计算中心将多个数据库整合在一起提供综合服务，如EBI的SRS(Sequence Retrieval System)包含了核酸序列库、蛋白质序列库，三维结构库等30多个数据库及CLUSTALW、PROSITESEARCH等强有力的搜索工具，用户可以进行多个数据库的多种查询。
下面循序简介一些著名和有特色的生物信息数据库。
基因和基因组数据库
1. Genbank
Genbank库包含了所有已知的核酸序列和蛋白质序列，以及与它们相关的文献著作和生物学注释。它是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)建立和维护的。它的数据直接来源于测序工作者提交的序列；由测序中心提交的大量EST序列和其它测序数据；以及与其它数据机构协作交换数据而来。Genbank每天都会与欧洲分子生物学实验室(EMBL)的数据库，和JP的DNA数据库(DDBJ)交换数据，使这三个数据库的数据同步。Genbank的数据可以从NCBI的FTP服务器上免费下载完整的库，或下载积累的新数据。NCBI还提供广泛的数据查询、序列相似性搜索以及其它分析服务，用户可以从NCBI的主页上找到这些服务。
Genbank库里的数据按来源于约55,000个物种，其中56%是人类的基因组序列(所有序列中的34%是人类的EST序列)。每条Genbank数据记录包含了对序列的简要描述，它的科学命名，物种分类名称，参考文献，序列特征表，以及序列本身。序列特征表里包含对序列生物学特征注释如：编码区、转录单元、重复区域、突变位点或修饰位点等。所有数据记录被划分在若干个文件里，如细菌类、病毒类、灵长类、啮齿类，以及EST数据、基因组测序数据、大规模基因组序列数据等16类，其中EST数据等又被各自分成若干个文件。
(1)Genbank数据检索
NCBI的数据库检索查询系统是Entrez。Entrez是基于Web界面的综合生物信息数据库检索系统。利用Entrez系统，用户不仅可以方便地检索Genbank的核酸数据，还可以检索来自Genbank和其它数据库的蛋白质序列数据、基因组图谱数据、来自分子模型数据库(MMDB)的蛋白质三维结构数据、种群序列数据集、以及由PubMed获得Medline的文献数据。
Entrez提供了方便实用的检索服务，所有操作都可以在网络浏览器上完成。用户可以利用Entrez界面上提供的限制条件(Limits)、索引(Index)、检索历史(History)和剪贴板(Clipboard)等功能来实现复杂的检索查询工作。对于检索获得的记录，用户可以选择需要显示的数据，保存查询结果，甚至以图形方式观看检索获得的序列。更详细的Entrez使用说明可以在该主页上获得。
(2)向Genbank提交序列数据
测序工作者可以把自己工作中获得的新序列提交给NCBI，添加到Genbank数据库。这个任务可以由基于Web界面的BankIt或独立程序Sequin来完成。BankIt是一系列表单，包括联络信息、发布要求、引用参考信息、序列来源信息、以及序列本身的信息等。用户提交序列后，会从电子邮件收到自动生成的数据条目，Genbank的新序列编号，以及完成注释后的完整的数据记录。用户还可以在BankIt页面下修改已经发布序列的信息。BankIt适合于独立测序工作者提交少量序列，而不适合大量序列的提交，也不适合提交很长的序列，EST序列和GSS序列也不应用BankIt提交。BankIt使用说明和对序列的要求可详见其主页面。
大量的序列提交可以由Sequin程序完成。Sequin程序能方便的编辑和处理复杂注释，并包含一系列内建的检查函数来提高序列的质量保证。它还被设计用于提交来自系统进化、种群和突变研究的序列，可以加入比对的数据。Sequin除了用于编辑和修改序列数据记录，还可以用于序列的分析，任何以FASTA或ASN.1格式序列为输入数据的序列分析程序都可以整合到Sequin程序下。在不同操作系统下运行的Sequin程序都可以在
ftp://ncbi.nlm.nih.gov/sequin/
下找到，Sequin的使用说明可详见其网页。
NCBI的网址是：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov
。
Entrez的网址是：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/
。
BankIt的网址是：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BankIt
。
Sequin的相关网址是：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Sequin/
。
2. EMBL核酸序列数据库
EMBL核酸序列数据库由欧洲生物信息学研究所(EBI)维护的核酸序列数据构成，由于与Genbank和DDBJ的数据合作交换，它也是一个全面的核酸序列数据库。该数据库由Oracal数据库系统管理维护，查询检索可以通过通过因特网上的序列提取系统(SRS)服务完成。向EMBL核酸序列数据库提交序列可以通过基于Web的WEBIN工具，也可以用Sequin软件来完成。
数据库网址是：
http://www.ebi.ac.uk/embl/
。
SRS的网址是：
http://srs.ebi.ac.uk/
。
WEBIN的网址是：
http://www.ebi.ac.uk/embl/Submission/webin.html
。
3. DDBJ数据库
JPDNA数据仓库(DDBJ)也是一个全面的核酸序列数据库，与Genbank和EMBL核酸库合作交换数据。可以使用其主页上提供的SRS工具进行数据检索和序列分析。可以用Sequin软件向该数据库提交序列。
DDBJ的网址是：
http://www.ddbj.nig.ac.jp/
。
4. GDB
基因组数据库(GDB)为人类基因组计划(HGP)保存和处理基因组图谱数据。GDB的目标是构建关于人类基因组的百科全书，除了构建基因组图谱之外，还开发了描述序列水平的基因组内容的方法，包括序列变异和其它对功能和表型的描述。目前GDB中有：人类基因组区域(包括基因、克隆、amplimers PCR 标记、断点breakpoints、细胞遗传标记cytogenetic markers、易碎位点fragile sites、EST序列、综合区域syndromic regions、contigs和重复序列)；人类基因组图谱(包括细胞遗传图谱、连接图谱、放射性杂交图谱、content contig图谱和综合图谱等)；人类基因组内的变异(包括突变和多态性，加上等位基因频率数据)。GDB数据库以对象模型来保存数据，提供基于Web的数据对象检索服务，用户可以搜索各种类型的对象，并以图形方式观看基因组图谱。
GDB的网址是：
http://www.gdb.org
。
GDB的国内镜像是：
http://gdb.pku.edu.cn/gdb/
。
蛋白质数据库
1. PIR和PSD
PIR国际蛋白质序列数据库(PSD)是由蛋白质信息资源(PIR)、慕尼黑蛋白质序列信息中心(MIPS)和JP国际蛋白质序列数据库(JIPID)共同维护的国际上最大的公共蛋白质序列数据库。这是一个全面的、经过注释的、非冗余的蛋白质序列数据库，其中包括来自几十个完整基因组的蛋白质序列。所有序列数据都经过整理，超过99%的序列已按蛋白质家族分类，一半以上还按蛋白质超家族进行了分类。PSD的注释中还包括对许多序列、结构、基因组和文献数据库的交叉索引，以及数据库内部条目之间的索引，这些内部索引帮助用户在包括复合物、酶－底物相互作用、活化和调控级联和具有共同特征的条目之间方便的检索。每季度都发行一次完整的数据库，每周可以得到更新部分。
PSD数据库有几个辅助数据库，如基于超家族的非冗余库等。PIR提供三类序列搜索服务：基于文本的交互式检索；标准的序列相似性搜索，包括BLAST、FASTA等；结合序列相似性、注释信息和蛋白质家族信息的高级搜索，包括按注释分类的相似性搜索、结构域搜索GeneFIND等。
PIR和PSD的网址是：
http://pir.georgetown.edu/
。
数据库下载地址是：
ftp://nbrfa.georgetown.edu/pir/
。
2. SWISS-PROT
SWISS-PROT是经过注释的蛋白质序列数据库，由欧洲生物信息学研究所(EBI)维护。数据库由蛋白质序列条目构成，每个条目包含蛋白质序列、引用文献信息、分类学信息、注释等，注释中包括蛋白质的功能、转录后修饰、特殊位点和区域、二级结构、四级结构、与其它序列的相似性、序列残缺与疾病的关系、序列变异体和冲突等信息。SWISS-PROT中尽可能减少了冗余序列，并与其它30多个数据建立了交叉引用，其中包括核酸序列库、蛋白质序列库和蛋白质结构库等。
利用序列提取系统(SRS)可以方便地检索SWISS-PROT和其它EBI的数据库。SWISS-PROT只接受直接测序获得的蛋白质序列，序列提交可以在其Web页面上完成。
SWISS-PROT的网址是：
http://www.ebi.ac.uk/swissprot/
。
3. PROSITE
PROSITE数据库收集了生物学有显著意义的蛋白质位点和序列模式，并能根据这些位点和模式快速和可靠地鉴别一个未知功能的蛋白质序列应该属于哪一个蛋白质家族。有的情况下，某个蛋白质与已知功能蛋白质的整体序列相似性很低，但由于功能的需要保留了与功能密切相关的序列模式，这样就可能通过PROSITE的搜索找到隐含的功能motif，因此是序列分析的有效工具。PROSITE中涉及的序列模式包括酶的催化位点、配体结合位点、与金属离子结合的残基、二硫键的半胱氨酸、与小分子或其它蛋白质结合的区域等；除了序列模式之外，PROSITE还包括由多序列比对构建的profile，能更敏感地发现序列与profile的相似性。PROSITE的主页上提供各种相关检索服务。
PROSITE的网址是：
http://www.expasy.ch/prosite/
。
4. PDB
蛋白质数据仓库(PDB)是国际上唯一的生物大分子结构数据档案库，由美国Brookhaven国家实验室建立。PDB收集的数据来源于X光晶体衍射和核磁共振(NMR)的数据，经过整理和确认后存档而成。目前PDB数据库的维护由结构生物信息学研究合作组织(RCSB)负责。RCSB的主服务器和世界各地的镜像服务器提供数据库的检索和下载服务，以及关于PDB数据文件格式和其它文档的说明，PDB数据还可以从发行的光盘获得。使用Rasmol等软件可以在计算机上按PDB文件显示生物大分子的三维结构。
RCSB的PDB数据库网址是：
http://www.rcsb.org/pdb/
。
5. SCOP
蛋白质结构分类(SCOP)数据库详细描述了已知的蛋白质结构之间的关系。分类基于若干层次：家族，描述相近的进化关系；超家族，描述远源的进化关系；折叠子(fold)，描述空间几何结构的关系；折叠类，所有折叠子被归于全α、全β、α/β、α＋β和多结构域等几个大类。SCOP还提供一个非冗余的ASTRAIL序列库，这个库通常被用来评估各种序列比对算法。此外，SCOP还提供一个PDB-ISL中介序列库，通过与这个库中序列的两两比对，可以找到与未知结构序列远缘的已知结构序列。
SCOP的网址是：
http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/
。
6. COG
蛋白质直系同源簇(COGs)数据库是对细菌、藻类和真核生物的21个完整基因组的编码蛋白，根据系统进化关系分类构建而成。COG库对于预测单个蛋白质的功能和整个新基因组中蛋白质的功能都很有用。利用COGNITOR程序，可以把某个蛋白质与所有COGs中的蛋白质进行比对，并把它归入适当的COG簇。COG库提供了对COG分类数据的检索和查询，基于Web的COGNITOR服务，系统进化模式的查询服务等。
COG库的网址是：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/COG
。
下载COG库和COGNITOR程序在：
ftp://ncbi.nlm.nih.gov/pub/COG
。
功能数据库
1. KEGG
京都基因和基因组百科全书(KEGG)是系统分析基因功能，联系基因组信息和功能信息的知识库。基因组信息存储在GENES数据库里，包括完整和部分测序的基因组序列；更高级的功能信息存储在PATHWAY数据库里，包括图解的细胞生化过程如代谢、膜转运、信号传递、细胞周期，还包括同系保守的子通路等信息；KEGG的另一个数据库是LIGAND，包含关于化学物质、酶分子、酶反应等信息。KEGG提供了Java的图形工具来访问基因组图谱，比较基因组图谱和操作表达图谱，以及其它序列比较、图形比较和通路计算的工具，可以免费获取。
KEGG的网址是：
http://www.genome.ad.jp/kegg/
。
2. DIP
相互作用的蛋白质数据库(DIP)收集了由实验验证的蛋白质－蛋白质相互作用。数据库包括蛋白质的信息、相互作用的信息和检测相互作用的实验技术三个部分。用户可以根据蛋白质、生物物种、蛋白质超家族、关键词、实验技术或引用文献来查询DIP数据库。
DIP的网址是：
http://dip.doe-mbi.ucla.edu/
。
3. ASDB
可变剪接数据库(ASDB)包括蛋白质库和核酸库两部分。ASDB(蛋白质)部分来源于SWISS-PROT蛋白质序列库，通过选取有可变剪接注释的序列，搜索相关可变剪接的序列，经过序列比对、筛选和分类构建而成。ASDB(核酸)部分来自Genbank中提及和注释的可变剪接的完整基因构成。数据库提供了方便的搜索服务。
ASDB的网址是：
http://cbcg.nersc.gov/asdb
。
4. TRRD
转录调控区数据库(TRRD)是在不断积累的真核生物基因调控区结构－功能特性信息基础上构建的。每一个TRRD的条目里包含特定基因各种结构－功能特性：转录因子结合位点、启动子、增强子、静默子、以及基因表达调控模式等。TRRD包括五个相关的数据表：TRRDGENES(包含所有TRRD库基因的基本信息和调控单元信息)；TRRDSITES(包括调控因子结合位点的具体信息)；TRRDFACTORS(包括TRRD中与各个位点结合的调控因子的具体信息)；TRRDEXP(包括对基因表达模式的具体描述)；TRRDBIB(包括所有注释涉及的参考文献)。TRRD主页提供了对这几个数据表的检索服务。
TRRD的网址是：
http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/mgs/dbases/trrd4/
。
5. TRANSFAC
TRANSFAC数据库是关于转录因子、它们在基因组上的结合位点和与DNA结合的profiles的数据库。由SITE、GENE、FACTOR、CLASS、MATRIX、CELLS、METHOD和REFERENCE等数据表构成。此外，还有几个与TRANSFAC密切相关的扩展库：PATHODB库收集了可能导致病态的突变的转录因子和结合位点；S/MART DB收集了与染色体结构变化相关的蛋白因子和位点的信息；TRANSPATH库用于描述与转录因子调控相关的信号传递的网络；CYTOMER库表现了人类转录因子在各个器官、细胞类型、生理系统和发育时期的表达状况。TRANSFAC及其相关数据库可以免费下载，也可以通过Web进行检索和查询。
TRANSFAC的网址是：
http://transfac.gbf.de/TRANSFAC/
。
其它数据库资源
1. DBCat
DBCat是生物信息数据库的目录数据库，它收集了500多个生物信息学数据库的信息，并根据它们的应用领域进行了分类。包括DNA、RNA、蛋白质、基因组、图谱、蛋白质结构、文献著作等基本类型。数据库可以免费下载或在网络上检索查询。
DBCat的网址是：
http://www.infobiogen.fr/services/dbcat/
。
下载DBCat在：
ftp://ftp.infobiogen.fr/pub/db/dbcat
。
2. PubMed
PubMed是NCBI维护的文献引用数据库，提供对MEDLINE、Pre-MEDLINE等文献数据库的引用查询和对大量网络科学类电子期刊的链接。利用Entrez系统可以对PubMed进行方便的查询检索。
PubMed的网址是：
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
。
除了以上提及的数据之外，还有许许多多的专门生物信息数据库，涉及了目前生物学研究的各个层面和领域，由于篇幅所限无法一一详述。国内也有一些大数据库的镜像站点和自己开发的有特色的数据库，如欧洲分子生物学网络组织EMBNet中国节点北京大学分子生物信息镜像系统，上海博容基因公司与上海嘉瑞软件公司合作开发的国产汉化基因数据库及分析管理系统，同时国家级的生物信息学中心也在筹建之中。我们期待国内能有更多高质量和使用便利的数据库资源，推动我国生物信息学和整个生命科学的发展。
清华大学生物信息学研究所网址：
http://bioinfo.tsinghua.edu.cn
北京大学生物信息镜像系统网址：
http://cbi.pku.edu.cn
国外生物医学类（转贴）
Genes & Development
基因与发育 (英国) http://207.22.83.2:443/cshl/journals/gnd
该杂志是由英国遗传协会出版的每月两期的刊物. 1995年被评为科学界十大优秀期刊之一，论文很优秀。目前此页面提供了自95年1月至今的各期的文章目录及摘要.
The Lancet
柳叶刀(美国) http://www.thelancet.com
<柳叶刀>>创立于1823年，是一本在世界医学界很著名的杂志. 该WWW页面提供读者大量的在线论文全文。用户只需注册登记就可以浏览，这一切都是免费的.
Immunity
免疫学 (美国) http://www.immunity.com
是由美国细胞学出版社出版的刊物. 该站点提供了1994-1995年的所有文章摘要及1996年至今的所有文章的全文. 读者可在线免费阅读.
American Medical Association Publishing
美国医学协会出版物 http://www.ama-assn.org/public/journals/pubhome.htm
此站点提供了美国医学协会出版的在线刊物及新闻，文摘或全文全部免费阅读.其中包括:
The Journal of American Medical Association
http://www.ama-assn.org/public/journals/jama/jamahome.htm
American Medical News
http://www.ama-assn.org/public/journals/amnews/amnews.htm
Archive of Internal Medicine
http://www.ama-assn.org/public/journals/inte/intehome.htm
Archives of Dermatology
http://www.ama-assn.org/public/journals/derm/dermhome.htm
Archives of Family Medicine
http://www.ama-assn.org/public/journals/fami/famihome.htm
Archives of Ophthalmology
http://www.ama-assn.org/public/journals/opht/ophthome.htm
Archives of Neurology
http://www.ama-assn.org/public/journals/neur/neurhome.htm
The Archives of General Psychiatry
http://www.ama-assn.org/public/journals/psyc/psychome.htm
Archives Journal Club-Women's Health
http://www.ama-assn.org/public/journals/womh/womhhome.htm
Archives of Otolaryngology-Head & Neck Surgery
http://www.ama-assn.org/public/journals/otol/otolhome.htm
Archives of Surgery
http://www.ama-assn.org/public/journals/surg/surghome.htm
Archives of Pediatrics & Adolescent Medicine
http://www.ama-assn.org/public/journals/ajdc/ajdchome.htm
American Medical Association Science News Updates
http://www.ama-assn.org/sci-pubs/sci-news/1997/pres_rel.htm
New England Journal of Medicine
新英格兰医学杂志(美国) http://www.nejm.org
该杂志是一本周刊，报道世界上重要的医学研究成果. 由此页面可查询过刊的全部信息，也可阅读现刊的论文摘要.
Antimicrobial Agents and Chemotherapy
抗菌剂与化学治疗(期刊) (美国)
http://asmusa.edoc.com/aac
这是由美国生物学会出版的一本期刊. 其目的是报导目前正在研究的有关在抗菌，抗寄生虫，抗癌制剂与化学治疗等方面的信息. 该页面提供了自97年1月以来出版的的各期文章目录及文章摘要.
American College of Physician
美国内科医生学会杂志.
http://www.acponline.org/journals/journals.htm
这是一本双月刊，汇集了美国国内著名医学杂志上的重点文章。 该页面提供其过刊及现刊的文章， 其中包括全文和摘要.
American Family Physician
美国家庭保健医生杂志
http://www.aafp.org/afp
这是由美国家庭保健医科院创办的一份刊物。此页面给出了现刊及部分过刊的文章全文及摘要。还可以进入"疾病咨询"栏目, 帮助你解除疾病带给你的痛苦。
The Journal of Neuroscience
神经学杂志 (美国) http://www.jneurosci.org
这是由美国神经学会创办的一份刊物. 由该主页可以进入现刊内容摘要及全文阅读、过刊内容的查找及网上阅读. 并提供一个方便的查询界面，可根据作者名查询、也可用关键词进行查找.
Emerging Infectious Diseases
急性传染性疾病 http://www.cdc.gov/ncidod/EID/eid.htm
这是由美国国家传染病中心创办的刊物. 该页面提供了自95年至97年各期的文章，读者可免费阅读及下载.
Cell
细胞 (美国) http://www.cell.com
这是一本著名的医学杂志，刊登权威性的文章. 该主页可以对1996年至今的所有文章的作者及题目进行检索，若需全文，则需要花钱注册. 该站点还提供了免费检索工作机会数据库，用户可以查询到各大洲生物学领域里的工作机会现况.
Neuron
神经元 (美国) http://www.neuron.org
这是由美国细胞学出版社出版的月刊 . 该站点提供了自1988年至今的所有文章摘要，并且还可免费全文阅读1996年至今的所有文章.
International Journal for Vitamin and Nutrition Research
国际维生素与营养研究杂志 http://verlag.hanshuber.com/Zeitschriften/IJVNR
Canadian Journal of Physiology and Pharmacology
加拿大生理学与药理学期刊 http://www.nrc.ca/cisti/journals/cjppep.html
由加拿大科技信息研究所编辑发行的月刊. 目前它的电子版将96年至今的各期的目录及全文放在此页面上，用户可免费阅读。但其格式为PDF文件格式.
Nature Medicine
自然医学杂志 (英国) http://medicine.nature.com
由自然杂志社出版的，主要刊登有关生物医学方面的研究论文. 目前该网页提供了96年至97年各期刊登的文章目录及内容摘要.
British Medical Journal
英国医学杂志 http://www.bmj.com/bmj
英国医学杂志每年出版四期. 该页面提供了95年至97年各期的论文摘要或部分全文.
Magzine
杂志 http://members.tripod.com/~wxp/medmag.htm
这是有关医学杂志超链接的页面，由此页面可以超链进入几百种杂志的WWW页面.
Nature Structural Biology
自然结构生物 (美国) http://structbio.nature.com
该杂志是自然杂志的姊妹篇，主要是报道有关生物分子结构方面的研究文章. 目前此站点提供了96年3月--97年的各期的目录及文章摘要.
The Journal of Biological Chemistry
生物化学杂志 (美国) http://www.jbc.org
这是由美国生物化学与分子生物协会出版的刊物. 刊登有关通信、碳水化合物、细胞学和新陈代谢、蛋白质化学结构、核酸系列、蛋白质合成、分子遗传学等方面的文章. 它的WWW主页提供了免费查找的期刊，免费阅读全文或摘要 。
Biochemistry and Cell Biology
生物化学与细胞生物学(加拿大) http://www.nrc.ca/cisti/journals/cjbioep.html
这是由加拿大科技信息研究所编辑发行的月刊. 是加拿大在生物化学与细胞生物学领域中较有影响的刊物. 目前该页面提供的大部分是各期的文章目录及简介，也可浏览少部分文章的全文.
Biochemical Journal
生物化学杂志(英国) http://www.portlandpress.co.uk/bj
这是由英国生物化学协会编辑发行的一本关于生物化学，细胞和分子生物学方面文章的杂志. 每年要发表8000篇高质量的科技论文. 目前该页面提供了95-97年的可在线阅读的文章.
Nature Biotechnology
自然生物技术(英国) http://biotech.nature.com
这是由自然杂志社出版的关于生物技术的杂志，刊登一些较深入的科技报告. 该站点提供了96年至97年各期的文章题目和作者，并可免费阅读一些文章的全文或摘要.
BioWorld Today Online
生物世界今天(在线) http://www.bioworld.com
<<生物世界今天>>是由美国健康顾问委员会出版的杂志，旨在为生物技术工业及商业提供新闻服务. 此主页可进行检索，通过关键词可查询到作者、刊号及文章.
Nucleic Acids Research Online
核酸研究在线 (英国) http://www.oup.co.uk/nar
这是由牛津大学出版社发行的刊物.目前该页面提供了查询系统，可检索其过刊或现刊的文章题目、作者、摘要，部分文章可阅读全文.
Human Genome News Newsletter
基因组新闻快报(美国) http://www.ornl.gov/hgmis/publicat/publications.html#hgn
美国能源部人类基因组研究小组创办的基因组新闻快报，目的是为公众提供该组在遗传学领域里的研究进展. 在该页面，读者可以浏览自1989年至1997年的所有新闻文章，也可以分类方式查找文章.
Primer on Molecular Genetics
分子遗传学初步(美国) http://www.ornl.gov/hgmis/publicat/primer/intro.html
这是专门发表美国能源部人类基因组研究小组的科技报告的刊物. 在此页面，读者可以浏览1991-1992年的科技报告.
Nature Genetics
自然遗传学 (英国) http://genetics.nature.com
自然遗传学杂志是自然杂志的姊妹篇，每月一期，专门报道遗传学领域里的人类基因组方面的新闻及研究文章. 目前该网页提供了96年至97年各期的目录，并可在线阅读文章的摘要，可全文阅读部分文章.
歌厅根大学国家图书馆
SUB G?ttingen - Willkommen歌厅根大学国家图书馆，SupFree0在电子杂志一栏可以找到很多经济学国际杂志，SupFree0大部分为英文.
http://www.sub.uni-goettingen.de/welcome.htm